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气相色谱仪对温度环境的要求并不特殊。通常，在5至35℃的室温条件下可满足操作要求，并且湿度环境通常需要为20％至85％。在高湿度区域，当使用某些类型的气相色谱仪时，由于高环境湿度，气相色谱仪的绝缘性能会降低，如果操作灵敏度高，响应值会降低。使用气相色谱仪时，工作人员在遇到上述现象时应采取必要措施。
