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其一，气相色谱仪器多数问题出现原因在于仪器缺乏维护，如没有及时更换耗材（进样垫、衬管、O型圈以及气体净化装置等
其二，则是由于没有按照正常的规程和要求进行仪器操作，如气相色谱仪色谱柱安装的长度不对等。
其三，则可能是由操作人员分析过程引起，如样品前处理不当，手动进样不熟练等；还可能由实验室环境及气相色谱仪故障引起，包括实验室电路接地不佳、管路漏气、部件损坏等。
